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发表于 2024-8-31 18:24:43
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刘琦，同济大学生物信息系长聘教授，博士生导师，同济大学上海自主智能无人系统科学中心PI。国家级青年人才。长期致力于发展人工智能和生物组学融合的交叉研究新范式（AI for Omics），赋能组学数据的AI智能解析和精准干预，进行数据驱动的精准医学研究和转化。近年来发展了一系列面向组学数据多尺度（单细胞组学），跨模态（多模态组学），有扰动（扰动组学）等特点的AI智能解析的计算方法和计算模型（Cell Genomics 2024; Science Advances 2020; Nature Communications 2019; Genome Biology 2024, 2022; Nucleic Acids Research 2021; Science China – Life Science 2024, 2022），并基于组学智能解析形成面向复杂疾病（如肿瘤）的精准干预：包括精准药物诊疗（Nature Communications 2021，2015；Genome Medicine 2023; Science Bulletins 2022a；Chemical Science 2020），精准免疫治疗（Nature Machine Intelligence 2023a, 2023b; Genome Medicine 2019），以及精准基因编辑（Nature Communications 2023; Genome Biology 2018; Science Bulletins 2022b; Nucleic Acids Research 2020）。受邀在Trends 和WIREs系列（Trends Mol. Med. 2019; Trends Pharmacol. Sci. 2017; Trends Biotechnol. 2016, WIREs Comput. Mol. Sci. 2018）以及计算机科学领域重要期刊会议如IEEE TKDE/SDM/ICDM等发表综述及论文。其成果先后被Nature Machine Intelligence进行Research Highlight,Cell Genomics Featured Article, 2次入选中国生物信息学算法十大进展，获F1000推荐，入选Trends系列年度“Best of Trends”Award。著《组学机器学习》（科学出版社，2023）。授权精准干预相关发明专利4项（2项组合用药，1项新抗原，1项基因编辑），和罗氏合作申请PCT专利1项（基因编辑）。任ELSEVIER出版社人工智能生命科学交叉领域期刊Artificial Intelligence in the Life Sciences编委，华为公司科学顾问。曾入选《麻省理工科技评论》中国智能计算创新人物、获药明康德生命化学研究奖、吴文俊人工智能自然科学技术奖、微众学者奖、上海生物信息学会“青年卓越奖”等。入选上海市浦江人才、上海市科技启明星人才、上海市曙光人才、上海市优秀学术带头人。
目前主持及参与了科技部BT&IT重大专项、精准医学重点研发计划、慢病专项重点研发计划，科技部863计划生物信息学重大专项，国家自然科学基金委生命语言AI重点专项，上海市基础特区项目，上海市计算生物学重点专项等多项国家和省部级项目。和国际制药公司及互联网公司开展了广泛的合作。同时承担学院本科生“机器学习理论与方法”（上海市一流课程、上海市重点课程建设、智慧树慕课）以及“生物信息学算法与实践”的专业必修课教学任务, 积极进行生物信息学、药物研发和人工智能方向的科普宣传（见: 生物信息学研究的思考，化学界诞生了一个AlphaGO,人工智能应用于新药研发的范式转变，联邦学习能否打破新药研发的反摩尔定律）,开展双语及全英文课程建设。于2018年-2023年共5年作为领队教练带领同济大学本科生团队获得国际合成生物学大赛（iGEM）金奖，并于2021年获得iGEM 软件赛道全球Best Software & AI Project奖（Village Awards）。
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发表于 2024-8-31 13:47:26
